目前，對鴨病毒性肝炎病還沒有特效藥物予以治療，因此重在預防。
首先，日常加強飼養管理、改善環境、嚴格執行消毒制度、搞好環境衛生等生物安全措施，對控制該病的發生具有重要的意義。
其次，采用康復鴨血清、高免鴨血清及高免卵黃抗體可有效控制本病。疫苗免疫接種的方法是：
①有母源抗體的雛鴨，在7-10日齡時肌肉注射鴨病毒性肝炎弱毒疫苗1羽份/只。
②無母源抗體的雛鴨，在出殼后1日齡即肌肉注射鴨病毒性肝炎弱毒疫苗1羽份/只或高免鴨血清及高免卵黃抗體0.5毫升/只，10日齡再注射鴨病毒性肝炎弱毒疫苗1羽份/只。
③種鴨在開產前12周、8周、4周分別用鴨病毒性肝炎弱毒疫苗免疫2-3次，其母鴨的抗體至少可以保持7個月；若在用弱毒疫苗基礎免疫后再肌肉注射鴨病毒肝炎滅活疫苗，則能在整個產蛋期內產生帶有母源抗體的后代雛鴨，其母源抗體可維持2周左右，并能有效抵抗強毒攻擊。
雛鴨一旦發生病毒性肝炎，應立即進行隔離治療。除嚴格消毒、在飼料中添加礦物質和維生素外，還必須肌肉注射高免鴨血清或高免卵黃抗體0.5毫升/只，10天后再肌肉注射鴨病毒性肝炎弱毒疫苗1羽份/只。