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雞使用微生態制劑后，可以提高雞的生產性能、飼料轉化率，改善禽舍環境，減少環境污染，提高免疫力，降低死亡率。呂景旭等(1998)用益生素(含蠟樣芽孢桿菌和地衣芽孢桿菌)飼喂肉仔雞，在0～3周齡，試驗組日增重比對照組高4.9%；在4～7周齡日增重比對照組高2.58%。井岡等(2003)在商品蛋雞中添加微生態制劑，結果試驗組蛋雞產蛋比對照組提高了5.35%，料蛋比提高了9.52%，平均蛋重提高了2.95%，死淘率降低了68.18%。羅世明等(1989)從正常雛雞群中分離到了3株雛雞乳桿菌，用它和酵母菌混合制成菌劑，可以顯著地提高日增重和飼料轉化率，并對白痢的防治效果明顯。

在豬的日糧或飲水中添加微生態制劑，可以提高日增重、飼料轉化率，促進生長發育，防治仔豬下痢和提高仔豬成活率，提高養殖效益。朱萬寶等(1994)將主要含蠟狀芽孢桿菌、糞鏈球菌等4種的復合益生菌劑加入斷奶仔豬飼料，結果表明用復合益生菌劑的試驗組可減少飼料消耗、提高增重及減少藥物開支，每頭豬直接增加經濟效益5.96元。李強等(2003)在斷奶仔豬日糧中添加0.5%的微生態制劑，與對照組相比，日增重提高了11.4%，腹瀉率降低了15%。楊林等(2003)研究表明：微生態制劑能不同程度地提高仔豬的平均日增重，顯著降低仔豬的腹瀉率(P<0.05)。

微生態制劑能夠改善反芻動物瘤胃發酵環境，提高飼料的消化和利用效率，提高反芻動物生產性能。王世榮等(2003)用由酵母菌、乳酸菌和芽孢桿菌復合菌組成的粉劑飼喂奶牛，試驗組比對照組產奶量增加7.26%。岳壽松等(2003)在黑白花奶牛試驗組日糧中添加50g微生態制劑，試驗組比同期對照組產奶量增加7.26%。那日蘇等(2004)用酵母培養物對放牧補飼綿羊做對比試驗，結果使日增重提高11.1%。

微生態制劑不僅可以抑制水產病原微生物的生長和繁殖，提高養殖對象的抗病力而且能利用水環境中過多的有機物合成菌體物質，從而降低環境中氨氮、亞硝酸氮、硫化氫等有害有毒物質的含量，增加溶氧的含量，凈化水產動物生存環境。劉淇等(2003)用活菌生物凈水劑進行的南美白對蝦飼養試驗結果表明：該微生態制劑產品顯著提高對蝦成活率，試驗組平均成活率為87.3%，而對照組為80.5%。劉克琳等(2000)用有益芽孢桿菌投喂鯉魚，試驗結果表明對鯉魚免疫器官的發育有一定的促進作用。張慶等(1999)每隔25天向羅非魚養殖水體中添加以芽孢桿菌為主的微生物復合菌劑，此制劑能有效降低氨氮與亞硝酸鹽的含量，維持和營造良好的水質條件，促進羅非魚的生長。

動物消化道微生物具有多樣性和特異性，不同動物種類對菌種的要求也不同，同一菌株用于不同的動物，往往產生的效果差異較大。使用時一定要了解菌種的性能和作用，選用合適的菌種，適于單胃動物的益生素所用菌株一般為乳酸菌、芽孢桿菌、酵母等，而適于反芻動物的是酵母菌。

應用時間要早，新生畜禽使用更佳，另外長時間連續飼喂效果更理想。當動物處于健康、生產性能良好時，添加芽胞桿菌并不能進一步提高動物的生產性能，而只是起到一定的保健作用。而當機體處于疾病，尤其是發生胃腸道疾病時，添加芽胞桿菌能起到較好的治療作用，并改善動物的生產性能。動物的年齡、性別、種類也影響芽胞桿菌的作用效果。

有效的活菌數是影響作用效果的關鍵因素之一，產品中必須含有相當數量的活菌數才能達到效果，但添加過量有時會適得其反，造成飼料成本上升。瑞典規定乳酸菌制劑活菌數要達到2×1011個/g。德國學者認為，仔豬飼料中加入微生態制劑其含菌量應達到0.2～0.5×107個/g飼料，育肥豬飼料中加入每克含106個芽胞桿菌而乳酸桿菌數量不少于107個/g。我國在正式批準生產的制劑中，對含菌數量和用量也有規定，芽孢桿菌含量≥5×108個/g。

微生態產品隨著保存時間的延長，活菌數量不斷減少，其速度因菌種和保存條件而異。厭氧菌暴露在空氣中很容易死亡，因此有的產品對其進行了包被處理，或者采用真空包裝，所以在打開包裝后應在規定的時間內用完。

由于益生菌制劑是活菌，抗生素和化學合成的抗菌劑對其有殺滅作用，因此一般都禁止與之敏感的抗生素如磺胺類或化學類藥物同時使用。另外有報道動物在用抗生素治療疾病后，用益生菌制劑快速恢復胃腸道功能效果很明顯。

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