一、動物疫病流行因素的復雜性
1、生態破壞與環境污染加劇疫病流行
人類過度活動加劇生態環境物種天然屏障破壞而致病毒種間傳播加劇；飼料污染、水污染、空氣污染與土壤污染等對動物健康造成影響，免疫抑制致動物免疫系統受到嚴重損害，免疫應答功能出現紊亂，動物長期處于亞健康狀態而對病原高度易感，導致疫病常年不斷甚至暴發流行。
2、毒素與濫用藥物加劇疫病危害
霉菌毒素對動物臟器產生毒性作用，引發免疫抑制，誘導免疫麻痹和免疫耐受造成免疫失敗；降低機體非特異性與特異性免疫力同時低下，機體抗病力不足以抵抗病原體的侵襲而致病。濫用藥物損害動物肝、腎等實質器官；有的抗生素抑制體液免疫和細胞免疫，致動物抗病力低下；長期濫用抗生素造成多重耐藥性毒株與菌株以及“超級細菌”的出現，致使病毒不斷發生變異及基因重組；細菌產生新的血清型，造成病原體毒力和致病力增強，必然會增加病原體引發動物疫病暴發流行的可能性；大量口服抗生素破壞動物體內菌群平衡、生態平衡，某些條件性致病菌乘機繁殖引發二重感染；長期濫用藥物造成藥物殘留影響動物健康、畜產品安全和人類健康。
3、不科學免疫加劇疫病流行
不按程序有計劃地科學有效合理免疫，頻繁多次重復接種，盲目增加疫苗劑量造成疫苗浪費和動物機體免疫麻痹與免疫耐受；減少疫苗接種劑量，會因抗原量不足影響疫苗免疫應答而造成免疫失敗。
二、動物病毒病的防治方針和原則
重大動物疫病防制實行“養重于防，預防為主，防重于治，防治結合”的方針，“加強領導、密切配合、依靠科學、依法防治、群防群控、果斷處置”的防控原則，關鍵在于生物安全、綜合保健和免疫治療。病毒呈絕對的細胞內寄生，目前沒有理想藥物用于臨床，或許多抗病毒藥物治療結果是病毒同其寄生的細胞“同歸于盡”，或其治療作用表現“為時已晚”。
三、病毒性傳染病的免疫特性
病毒易發生毒力變異和抗原變異，給病毒病的免疫預防造成很大困難。低毒力病毒（弱毒苗）的回復突變；許多具有主型或亞型的病毒大多容易發生抗原變異；病毒通過突變、重組、互補或表型混合出現新毒株，原對應的疫苗起不到預防作用。
病毒只能在細胞內增殖，病毒能避開藥物、抗體、補體、巨噬細胞或T細胞等體內外抗病毒物質的攻擊，故抗病毒免疫主要以細胞免疫為主。許多病毒病目前尚無有效疫苗，部分病毒病雖研制出相應疫苗但干擾現象普遍存在于病毒的同種、異種之間和滅活病毒與活病毒之間，故給病毒聯苗和多價苗的研制造成許多困難。病毒滅活苗在特定情況下通過部分核酸的重組、整合，又可拼湊成一個有毒力的完整病毒而誘發新的傳染。病毒弱毒苗在特定情況下可能出現毒力復壯（“返祖”）而引發新的傳染與流行。
四、動物病毒病臨床處置措施
1、緊急處置
對動物進行科學合理的免疫接種、有效驅蟲、全面藥浴、適時疫病監測，對動物飼養場所進行徹底有效消毒、生物安全控制、動物疫病的區域化管理和防疫承諾制等一系列綜合性措施，防止動物疫病的發生。發生動物疫病時，采取隔離、撲殺、消毒等措施，防止其擴散，做到有疫不流行；對已經存在的動物疫病，采取監測、淘汰等措施，逐步凈化直至達到消滅動物疫病。發生對人畜危害嚴重，可能造成重大經濟損失的動物疫病時，采取緊急、嚴厲、綜合的“封鎖、隔離、銷毀、消毒和無害化處理等”強制措施，迅速撲滅疫情。對動物疫病的撲滅應當采取“早、快、嚴、小”的原則。病死畜禽要不宰殺、不銷售、不食用、不轉運、對尸體進行無害化處理。
2、常規預防措施
加強飼養管理，堅持“自繁自養”原則，減少疫病傳播，采用“全進全出”的養殖模式，減少動物疫病交叉感染的機會。建立定期消毒制度，定期對圈舍、用具和運動場等進行預防性消毒，及時驅蟲、殺滅蚊蠅、老鼠，消滅傳染源的蓄積和擴散。免疫是當前防控動物病毒病最有效、最經濟的手段，必須按科學、合理的個性化免疫程序進行有效免疫，適時進行抗體監測和風險評估，及時查缺補漏。
3、臨床治療
受傳染性、致死性、經濟價值、公共安全等因素的綜合考量，動物病毒病在臨床上缺少特效治療藥品和方案。使用一些抗病毒藥物如干擾素、轉移因子、白細胞介素等來干擾病毒復制，或用特異性血清抗體、卵黃抗體中和病毒，或使用抗菌藥物防止繼發感染，或補液退燒抗炎進行對癥治療。解除動物疾病引發的不適狀態，恢復生理與生產性能，恢復其精神和食欲。使用免疫增強劑提高機體免疫力。使用特異性的疫苗來預防或緊急接種相對應的病毒性疾病。